MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Haemophilus influenzae R2866 chromosome

Total Repeats: 5601

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017451	T	6	6	1893	1898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017451	A	7	7	1901	1907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017451	ATT	2	6	1959	1964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017451	TA	3	6	2006	2011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017451	T	6	6	2020	2025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017451	AAC	2	6	2027	2032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017451	TAT	2	6	2037	2042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017451	T	6	6	2065	2070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017451	TAAG	2	8	2458	2465	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017451	TCA	2	6	3097	3102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017451	TGA	2	6	3104	3109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017451	TA	3	6	3121	3126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017451	TAAA	2	8	3136	3143	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017451	CTT	2	6	5304	5309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017451	AGA	2	6	6544	6549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017451	AAAAG	2	10	6554	6563	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017451	T	7	7	6584	6590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017451	ATT	2	6	6627	6632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017451	TAA	2	6	8379	8384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017451	CG	3	6	8403	8408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017451	AATG	2	8	9168	9175	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017451	TCTA	2	8	9206	9213	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017451	T	8	8	9222	9229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017451	ATA	2	6	9534	9539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017451	T	6	6	10289	10294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017451	GTT	2	6	10304	10309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017451	TAT	2	6	10330	10335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017451	AATT	2	8	10363	10370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017451	AATT	2	8	11952	11959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017451	T	6	6	12496	12501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017451	AGCC	2	8	12514	12521	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017451	T	7	7	12547	12553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017451	ATA	2	6	12554	12559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017451	AAG	2	6	12560	12565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017451	ATT	2	6	14902	14907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017451	T	7	7	14913	14919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017451	CTTTC	2	10	14924	14933	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_017451	T	6	6	14959	14964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017451	TTTA	2	8	14984	14991	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017451	CTTT	2	8	17477	17484	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017451	T	6	6	17521	17526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017451	TAA	2	6	18262	18267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017451	TAA	2	6	18983	18988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017451	T	6	6	20040	20045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017451	GAG	2	6	20049	20054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017451	TAT	2	6	20068	20073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017451	AAT	2	6	20080	20085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017451	TATTT	2	10	20100	20109	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017451	CTTT	2	8	20111	20118	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017451	ATC	2	6	20131	20136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017451	A	6	6	20149	20154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017451	TAAA	2	8	20156	20163	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017451	AGG	2	6	20170	20175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017451	TTA	2	6	21114	21119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017451	TTA	2	6	21145	21150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017451	A	8	8	21155	21162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017451	A	7	7	21211	21217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017451	T	7	7	21260	21266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017451	ATTT	2	8	23281	23288	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017451	TCT	2	6	23301	23306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017451	T	7	7	24570	24576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017451	ATT	2	6	24591	24596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017451	AAT	2	6	24625	24630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017451	ATA	2	6	26165	26170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017451	AAG	2	6	27415	27420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017451	TTA	2	6	29830	29835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017451	TAA	2	6	29883	29888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017451	TTG	2	6	31411	31416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017451	TAG	2	6	31433	31438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017451	A	6	6	31444	31449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017451	TTTA	2	8	31466	31473	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017451	TAT	2	6	32344	32349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017451	TAA	2	6	33226	33231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017451	TTA	2	6	33243	33248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017451	GTT	2	6	33254	33259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017451	ATT	2	6	33314	33319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017451	T	6	6	33318	33323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017451	A	6	6	33393	33398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017451	ATT	2	6	33402	33407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017451	AGA	2	6	33644	33649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017451	TCT	2	6	33682	33687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017451	T	6	6	33687	33692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017451	A	7	7	33726	33732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017451	TGG	2	6	33791	33796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017451	ATAAA	2	10	35247	35256	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017451	T	7	7	35275	35281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017451	AT	3	6	35291	35296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017451	TAA	2	6	35312	35317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017451	A	6	6	35316	35321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017451	TAG	2	6	35334	35339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017451	T	6	6	35387	35392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017451	TAA	2	6	37071	37076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017451	TTAA	2	8	37379	37386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017451	TGA	2	6	37397	37402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017451	TTG	2	6	37580	37585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017451	TTG	2	6	37612	37617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017451	TGT	2	6	37646	37651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017451	A	7	7	37697	37703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017451	AT	3	6	39386	39391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017451	ATT	2	6	39436	39441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017451	TCA	2	6	39620	39625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017451	A	7	7	41079	41085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017451	AATA	2	8	41118	41125	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017451	T	7	7	41148	41154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017451	TTG	2	6	41184	41189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017451	CTAA	2	8	41215	41222	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017451	AAGTAA	2	12	41261	41272	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017451	T	6	6	41326	41331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017451	AAGAT	2	10	43288	43297	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017451	T	7	7	43297	43303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017451	CGTGAT	2	12	45120	45131	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_017451	TTTAA	2	10	45478	45487	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017451	ATTTT	2	10	45500	45509	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017451	TAA	2	6	45541	45546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017451	TAA	2	6	45670	45675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017451	ACA	2	6	47322	47327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017451	GAA	2	6	48568	48573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017451	T	6	6	48626	48631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017451	ATA	2	6	48633	48638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017451	AGA	2	6	48670	48675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017451	TAA	2	6	48676	48681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017451	AG	3	6	48980	48985	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017451	GCG	2	6	48992	48997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017451	TTGA	2	8	49017	49024	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017451	AATTTT	2	12	49913	49924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017451	TGG	2	6	51134	51139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017451	CAT	2	6	51152	51157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017451	TTC	2	6	51167	51172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017451	T	7	7	52340	52346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017451	TTA	2	6	54019	54024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017451	AAT	2	6	54071	54076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017451	ATTT	2	8	54105	54112	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017451	TACAA	2	10	54197	54206	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017451	TTAAC	2	10	56642	56651	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017451	A	6	6	57951	57956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017451	TATT	2	8	57978	57985	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017451	AAG	2	6	58740	58745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017451	AAC	2	6	58755	58760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017451	TA	3	6	58770	58775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017451	TG	3	6	58814	58819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017451	AT	3	6	58825	58830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017451	TTA	2	6	58866	58871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017451	T	7	7	60061	60067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017451	TA	3	6	60083	60088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017451	CATT	2	8	60114	60121	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017451	GATT	2	8	60156	60163	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017451	CA	3	6	60224	60229	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017451	GTT	2	6	60254	60259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017451	AGTT	2	8	60353	60360	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017451	G	6	6	64504	64509	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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436	NC_017451	TAC	2	6	183829	183834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
437	NC_017451	TAA	2	6	183868	183873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
438	NC_017451	TTTA	2	8	183909	183916	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NC_017451	TTA	2	6	183943	183948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
440	NC_017451	GCA	2	6	183957	183962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
441	NC_017451	TTG	2	6	183990	183995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
442	NC_017451	TAT	2	6	184006	184011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_017451	T	6	6	184011	184016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_017451	TTA	2	6	184027	184032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_017451	TATC	2	8	184084	184091	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
446	NC_017451	TCTA	2	8	184092	184099	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
447	NC_017451	TAT	2	6	184114	184119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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450	NC_017451	CTTA	2	8	184253	184260	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
451	NC_017451	T	6	6	184261	184266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_017451	AAG	2	6	184284	184289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
453	NC_017451	TTGTT	2	10	184330	184339	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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457	NC_017451	TTG	2	6	184515	184520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
458	NC_017451	AAATCA	2	12	184541	184552	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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461	NC_017451	TGA	2	6	184854	184859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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464	NC_017451	TTG	2	6	187835	187840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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467	NC_017451	T	6	6	191333	191338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_017451	T	6	6	196090	196095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_017451	TGTTT	2	10	196105	196114	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
472	NC_017451	GAAT	2	8	196148	196155	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
473	NC_017451	AGC	2	6	196230	196235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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479	NC_017451	CAT	2	6	196486	196491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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481	NC_017451	TAAA	2	8	197745	197752	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_017451	A	6	6	197750	197755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_017451	TAA	2	6	199827	199832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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485	NC_017451	TAG	2	6	201100	201105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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497	NC_017451	TTC	2	6	211835	211840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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500	NC_017451	CAA	3	9	211921	211929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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